No hi ha una tècnica millor que una altra, perquè ambdues tenen avantatges i desavantatges. Depenent de les característiques de cada parella i la seva situació d'infertilitat, serà més recomanable dur a terme l'un o l'altre mètode per a fecundar a l'òvul.
Hi haurà casos com, per exemple, situacions de astenozoospèrmia greu, en les quals es necessitarà realitzar la ICSI per a tenir possibilitat d'aconseguir l'embaràs. No obstant això, en altres casos com les alteracions de l'ovulació o l'obstrucció tubárica, la FIV convencional podrà solucionar el problema.
La FIV convencional s'acosta més al procés natural i requereix menor manipulació. No obstant això, amb la ICSI estem un pas més prop de l'embaràs, perquè forcem la unió d'òvul i espermatozoide.