La teratozoospèrmia provoca infertilitat masculina deguda a un factor espermàtic. En primer lloc, els espermatozoides desproporcionats o amb una forma estranya no poden desplaçar-se correctament, per la qual cosa és més difícil que arribin fins a l'òvul que es troba en la trompa de Fal·lopi de la dona.
D'altra banda, una vegada han aconseguit l'òvul, almenys un espermatozoide ha de ser capaç de penetrar-lo perquè tingui lloc la fecundació. Les anomalies al cap dels espermatozoides poden dificultar aquesta acció.
Finalment, hi ha la possibilitat que els espermatozoides amb teratozoospèrmia sí que siguin capaços de donar lloc a un embaràs però, a continuació, la dona sofreixi avortaments de repetició deguts a les alteracions genètiques que es troben associades en alguns espermatozoides anormals.
En funció del tipus de teratozoospèrmia (lleu, moderada o severa), la consecució de l'embaràs natural es veurà dificultada en major o menor grau.
Cal destacar que els problemes d'infertilitat es veuen més acusats quan la teratospèrmia es diagnostica combinada amb una altra alteració seminal, com la concentració o la mobilitat espermàtica. Aquestes patologies es coneixen amb el nom de oligoteratozoospèrmia i astenoteratozoospèrmia, respectivament.