El procés per al PISCI és similar al que es es duu a terme per a la ICSI, amb la diferència del mètode de selecció espermàtica.
Una vegada que l'home ha obtingut la mostra per masturbació i amb un període d'abstinència de 3-5 dies, és necessari que sigui capacitada en el laboratori. D'aquesta manera es permet separar els espermatozoides vius de la resta de components del semen, és a dir, del plasma seminal i dels espermatozoides morts.
Quan la mostra seminal està capacitada, es procedeix a la selecció dels espermatozoides. Per a això, s'utilitza una placa especial en la qual hi ha unes gotes d'una substància similar a l'àcid hialurònic (HA). Els espermatozoides madurs i, per tant, amb major capacitat per a fecundar a l'òvul, es quedaran pegats a les gotes de HA i seran fàcil identificats pel personal del laboratori.
Finalment, s'aspiraran aquests espermatozoides i es microninyectarán de manera habitual en l'òvul.
